Семінарія знаходиться на березі Чорного моря біля стін Свято-Успенського чоловічого патріаршого монастиря. Більшість семінарських богослужінь служить у храмах обителі, багатої на шановані святині.

Серед уславлених великих святинь обителі широко відомі:
Стопа святого апостола Андрія Первозванного, перед якою відбуваються регулярні семінарські акафістні співи.

Чудотворна ікона Божої Матері «Млекопитачка» з частинками ризи Пресвятої Богородиці та хітона Спасителя. Щовівторка перед іконою відбувається акафістний спів, який очолює Високопреосвященніший Агафангел, Митрополит Одеський та Ізмаїльський.

Ковчег, в якому зберігаються: частинка Животворного Древа Чесного Хреста, на якому був розіп’ятий Господь наш Ісус Христос; частки мощів великих угодників ранньохристиянського періоду (І-VIII ст.) – праведної Анни, матері Пресвятої Богородиці, ап. Луки, влмч. Пантелеимона, святий. Григорія Богослова тощо.

Мощі прп. Кукші Одеського

Ковчег з частинками мощей великих угодників Божих, зокрема прп. Серафима Саровського.

Ікони Божої Матері «Отрада і Втіха» та «Скоропослушниці» написані на Св. горі Афон для Свято-Успенського Одеського чоловічого монастиря.

Некрополь Свято-Успенського чоловічого монастиря, де поховані архіпастирі Одеської єпархії, інших єпархій Руської Церкви, намісники, духовники та насельники обителі, серед яких схиархімандрити Павло, Іона, Іоіль, архімандрити Вадим та Никон.
Студенти мають нагоду помолитися біля мощів великих Одеських святителів, преподобних, праведних: Інокентія Одеського, Гавриїла Афонського, Іони Одеського. Особливо важливим для життя духовної школи є молитовне шанування чудотворної ікони Божої Матері «Касперівська» у Свято-Успенському кафедральному соборі м. Одеси.